hairpin2 package

Scientific Modules

• const module
  • ValidNucleotides
  • Strand
  • MutTypes
  • Tags
  • TaggerNamespaces
  • FlaggerNamespaces
• sci_funcs module
  • TagSupportingReads
  • TagLowQualReads
  • TagFragmentReads
  • TagStutterDuplicateReads
  • AlignmentScoreTest
  • AnomalousDistributionTest
  • ProportionBasedTest
• main module
  • hairpin2()

Subpackages

• infrastructure package
  • Submodules
    • cli module
    • configure_funcs module
    • process module
    • process_engines module
    • process_params module
    • rascheduler module
    • structures module
• process_wrappers package
  • Submodules
    • ADF module
    • ALF module
    • DVF module
    • LQF module
    • mark_overlap module
    • mark_support module
    • shared module